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法尼基焦磷酸合酶（一種異戊二烯基轉移酶）催化二甲基丙烯焦磷酸依次與兩個單位的3-異戊烯焦磷酸之間發生縮合反應，而形成了法尼基焦磷酸。
二甲基丙烯焦磷酸與3-異戊烯焦磷酸反應形成牻牛兒基焦磷酸：
牻牛兒基焦磷酸本身與3-異戊烯焦磷酸反應生成法尼基焦磷酸
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